地中の温度変化を計算する熱伝導方程式の離散化は時間方向には Clank-Nicolson 
法, 空間方向には中心差分を用いて行う. 温度と格子間隔を整数格子点, 熱フ
ラックスを半整数格子点で評価する. 鉛直方向の格子点数は 
 とし, 最下
層から 
 とする. 最上層の温度 
 が地表面温度 
 である.
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||
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(66) | 
ここで 
 である. 時刻 
 の
項を左辺に, 時刻 
 の項を右辺にまとめると,
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|||
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(67) | 
ここで 
 とした. 
 とすると, 行列式の形で
と表すことができる. ここで 
 はそれぞれ,

を要素に持つ 
 行列である.
上端での境界条件と下端で断熱境界条件を考慮すると,
(68)は
| (69) | 
| (70) | 
を解くことになる.
ここで係数行列 
 の第 1 行および第 
 行の対角要素は,

 は 
 行列ベクトルで,