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MPI のテスト

概要

国立天文台 CRAY XT4 にて, MPI 並列化のテストを行う. 非 MPI 版プログラムの出力結果と比較することで,

• MPI の通信がうまくいっているか
• 境界条件の適用がうまくいっているか
• リスタートがうまくいているか

確認する. なお, MPI 版のプログラムは 3000 秒からリスタートし, 非 MPI 版プログラムはリスタートしていない.

比較の結果

MPI 版と非 MPI 版で同じ結果が得られた. MPI 並列化はうまく動作しているようだ.

その他

これとは別の計算だが, 1 CPU 当たり格子点数 1024 x 300 の計算を 8 並列 で 24 時間動かすと, 1.85e5 秒積分することが可能. 北大 SR11000 では, 8 CPU の自動並列で 1024x300 の計算を 24 時間動かすと, およそ 3e6 秒積分 することが可能 (1 CPU あたり 3e6 / 8 = 3.75e5). SR11000 の方が速い.

もっとも, XT4 用に最適化された線形計算パッケージを使うともっと早くなる 可能性は否定できないし, 性能評価はしていない.

申請しなくても 128 コア(24 時間), 256 コア(12 時間), 1024 コア(8 時間) まで利用可能.

結果一覧

non-MPI	MPI
nonmpi_t0000.png	mpi_t0000.png
nonmpi_t1000.png	mpi_t1000.png
nonmpi_t2000.png	mpi_t2000.png
nonmpi_t3000.png	mpi_t3000.png
nonmpi_t4000.png	mpi_t4000.png
nonmpi_t5000.png	mpi_t5000.png
nonmpi_t6000.png	mpi_t6000.png